Rihmasienten tunnistus Vitek ® MS-laitteella
Rannikko, Emmi; Sillanaukee, Milja (2018)
Rannikko, Emmi
Sillanaukee, Milja
Tampereen ammattikorkeakoulu
2018
All rights reserved
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2018122422848
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2018122422848
Tiivistelmä
Dermatofyytit ja homeet eli rihmasienet aiheuttavat pinnallisia sieni-infektioita ihon ja kynsien sarveisaineessa. Tämän lisäksi homeet aiheuttavat myös syviä, invasoivia ja jopa kuolemaan johtavia infektioita immuunipuutteisilla potilailla. Diagnosoinnin nopeudella on suuri merkitys hoidon onnistumisessa. Sieniä tunnistetaan makroskooppisesti viljellyiltä maljoilta, joista tehdään tarvittaessa jatkoviljelmiä. Makroskooppisen tunnistuksen lisäksi apuna käytetään tarvittaessa värjäyksiä ja mikroskopointia. Nämä käytössä olevat rihmasienten tunnistusmenetelmät toimivat opinnäytetyön referenssi-menetelmänä.
Tämän opinnäytetyön tavoitteena oli tuottaa tietoa Fimlab laboratoriot Oy:n Tampereen mikrobiologian yksikölle Biomeriéuxin Vitek MS Mould –reagenssipakkauksen esikäsittelymenetelmän toimivuudesta ja siitä, nopeuttaako sen käyttö rihmasienten tunnistusta niin, että se kannattaa ottaa käyttöön uutena tutkimusmenetelmänä. Tutkimusotoksen tavoitteena oli sata analysoitua näytettä. Tarkoituksena oli koestaa uusi rihmasienille tarkoitettu reagenssipakkaus VITEK MALDI-TOF massaspektrometrille.
Tässä opinnäytetyönä tehdyssä tutkimuksessa koestettiin uusi Biomeriéuxin rihmasienille tarkoitettu esikäsittelymenetelmän reagenssipakkaus VITEK ® MS MALDI TOF-laitteelle. Fimlab Laboratoriot Oy:n mikrobiologian sienilaboratoriossa oli varattu potilasnäytteitä tätä tutkimusta varten. Näytteet käsiteltiin reagenssipakkauksen avulla ja analysointi suoritettiin VITEK ® MS-laitteella. Näitä analyysituloksia verrattiin referenssimenetelmillä saatuihin tuloksiin ja niiden yhteneväisyyttä tutkittiin Excel-taulukkolaskentaohjelmaa apuna käyttäen.
Tutkimuksessa oli mukana 68 rihmasieninäytettä, joista tulokset saatiin 49 näytteelle eli 72 prosentille kokonaisnäytemäärästä. 49:stä onnistuneesti analysoidusta näytteestä 42 näytteen tutkimustulokset VITEK ® MS-laitteella ja käytössä olevilla sienidiagnostiikan menetelmillä olivat yhteneväiset. Tulokset olivat siis 86 prosenttisesti yhteneväisiä. Tutkimuksessa havaittiin myös, että rihmasienten kasvunvaihe vaikuttaa VI-TEK ® MS-laitteella tehtyjen analyysien onnistumiseen.
Tämän opinnäytetyön tavoitteena oli tuottaa tietoa Fimlab laboratoriot Oy:n Tampereen mikrobiologian yksikölle Biomeriéuxin Vitek MS Mould –reagenssipakkauksen esikäsittelymenetelmän toimivuudesta ja siitä, nopeuttaako sen käyttö rihmasienten tunnistusta niin, että se kannattaa ottaa käyttöön uutena tutkimusmenetelmänä. Tutkimusotoksen tavoitteena oli sata analysoitua näytettä. Tarkoituksena oli koestaa uusi rihmasienille tarkoitettu reagenssipakkaus VITEK MALDI-TOF massaspektrometrille.
Tässä opinnäytetyönä tehdyssä tutkimuksessa koestettiin uusi Biomeriéuxin rihmasienille tarkoitettu esikäsittelymenetelmän reagenssipakkaus VITEK ® MS MALDI TOF-laitteelle. Fimlab Laboratoriot Oy:n mikrobiologian sienilaboratoriossa oli varattu potilasnäytteitä tätä tutkimusta varten. Näytteet käsiteltiin reagenssipakkauksen avulla ja analysointi suoritettiin VITEK ® MS-laitteella. Näitä analyysituloksia verrattiin referenssimenetelmillä saatuihin tuloksiin ja niiden yhteneväisyyttä tutkittiin Excel-taulukkolaskentaohjelmaa apuna käyttäen.
Tutkimuksessa oli mukana 68 rihmasieninäytettä, joista tulokset saatiin 49 näytteelle eli 72 prosentille kokonaisnäytemäärästä. 49:stä onnistuneesti analysoidusta näytteestä 42 näytteen tutkimustulokset VITEK ® MS-laitteella ja käytössä olevilla sienidiagnostiikan menetelmillä olivat yhteneväiset. Tulokset olivat siis 86 prosenttisesti yhteneväisiä. Tutkimuksessa havaittiin myös, että rihmasienten kasvunvaihe vaikuttaa VI-TEK ® MS-laitteella tehtyjen analyysien onnistumiseen.