Illumigenestä GenomEraan : Clostridium difficile – analyysimenetelmien vertailu
Ikonen, Anni; Kontio, Maijastiina (2016)
Ikonen, Anni
Kontio, Maijastiina
Oulun ammattikorkeakoulu
2016
All rights reserved
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2016102115315
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2016102115315
Tiivistelmä
Clostridium difficile on itiöitä muodostava suolistobakteeri, jonka jotkin kannat tuottavat toksiineja. Yleisimmät toksiini muodot ovat A ja B. C. difficilen aiheuttamia tauteja esiintyy maailmanlaajuisesti ja ne aiheuttavat vaikeita epidemioita. Vuonna 2014 Terveyden ja hyvinvoinninlaitos ilmoitti, että toksiinipositiivisia tapauksia löydettiin noin 5000 kappaletta. C. difficilen aiheuttamien tautitapausten määrä on pysynyt tasaisena, vaikka niiden määrä on laskenut viimeiset viisi vuotta. Ensisijaisena hoitona tautitapauksissa käytetään antibioottikuurin lopettamista tai vaihtamista toiseen. Tauti voi olla joissain tapauksissa hengenvaarallinen.
Opinnäytetyön tarkoituksena oli selvittää kahden C.difficile analyysimenetelmän herkkyyttä ja tarkkuutta mikrobiologian laboratoriossa. Menetelmiä verrattiin toisiinsa 147 kappaleella kliinisiä näytteitä.
C. difficilen diagnosointi perustuu kliiniseen kuvaan, ulostenäytteen toksiinien/toksiinigeenien osoitukseen tai viljelyyn. Vertailimme kahta nukleiinihappomenetelmää: Illumigenea ja GenomEraa. Illumigenessä käytetään LAMP-tekniikkaan, jossa DNA:n monistus tapahtuu vakiolämpötilassa. GenomEra on PCR-tekniikkaan perustuva DNA:n monistusmenetelmä.
Tuloksemme osoittivat, että molemmat menetelmät olivat spesifisiä ja herkkiä C.difficilen mittaamiseen.
Opinnäytetyön tarkoituksena oli selvittää kahden C.difficile analyysimenetelmän herkkyyttä ja tarkkuutta mikrobiologian laboratoriossa. Menetelmiä verrattiin toisiinsa 147 kappaleella kliinisiä näytteitä.
C. difficilen diagnosointi perustuu kliiniseen kuvaan, ulostenäytteen toksiinien/toksiinigeenien osoitukseen tai viljelyyn. Vertailimme kahta nukleiinihappomenetelmää: Illumigenea ja GenomEraa. Illumigenessä käytetään LAMP-tekniikkaan, jossa DNA:n monistus tapahtuu vakiolämpötilassa. GenomEra on PCR-tekniikkaan perustuva DNA:n monistusmenetelmä.
Tuloksemme osoittivat, että molemmat menetelmät olivat spesifisiä ja herkkiä C.difficilen mittaamiseen.