House-bakteerien tutkiminen ja tunnistus MALDI-TOF MS -tekniikalla

Abstract

House-bakteerilla tarkoitetaan sellaista mikro-organismia, joka on kehittynyt sietämään tehdasolosuhteita. Kyseinen mikrobi on kehittänyt selviytymisstrategioita, joita se käyttää apunaan selviytyäkseen eri stressitekijöistä, kuten laitteiden desinfioinneista ja puhdistuksista.

Strategioihin voivat kuulua esimerkiksi korkeampi lämmönsietokyky, korkeampi suola- tai klooripitoisuuden sietokyky sekä kyky suojautua UV-säteilyltä. Opinnäytetyön tarkoituksena oli selvittää, löytyykö suomalaisesta kosmetiikkatehtaasta mahdollisesti house-bakteereja. Bakteereja kerättiin tehtaan sisätilojen ilmasta laskeumamaljoille kuutena eri tutkimuskertana ja bakteerit tunnistettiin MALDI-TOFmassaspektrometrillä. Tavoitteena oli löytää sellaiset bakteerit, jotka ovat sopeutuneet tehtaan olosuhteisiin, ja ryhtyä jatkotoimenpiteisiin.

Opinnäytetyössä käytiin läpi mikrobien yleisimpiä selviytymisstrategioita, kuten pigmenttien tai lämpöshokkiproteiinien käyttöä. Lisäksi tutustuttiin kolmeen kosmetiikkateollisuudelle vaarallisimpaan mikrobiin ja niiden käyttämiin strategioihin. Työssä käsitellään myös lyhyesti yleistyvää MALDI-TOF MS–tekniikkaa sekä bakteerien tunnistamiseen käytettyä SARAMIS™-tietokantaa. Opinnäytetyötutkimuksessa ei löydetty house-bakteereja. Kosmetiikkayritys käyttää opinnäytetyössä kerättyä informaatiota jatkossa tuotekehityksessään.

A house bacterium is a microorganism that has developed to tolerate conditions in a manufacturing plant. It has developed survival strategies which it uses to survive an area of different stress factors, such as sanitizing or cleaning. These strategies may include increased heat tolerance, higher saline or chlorine concentration tolerance or resistance to UV radiation.

The purpose of this study was to research if there are any house organisms in a Finnish cosmetics manufacturing plant. Samples of bacteria were collected from the indoor air using petri dishes with nutrient agar. These samples were gathered in a total of six days of research and the found bacteria were identified using MALDI – TOF – mass spectrometry. The goal was to find any bacteria that had adapted to the living conditions of the plant and possibly take further action.

The thesis researches the most common survival strategies of microbes, such as pigments and heat shock proteins. It also examines three of the most dangerous microbes in cosmetics industry and the strategies these microbes use to survive. This thesis also briefly covers the increasingly popular MALDI – TOF MS technology and the SARAMIS™ database that is used to identify unknown microorganisms.

No house organisms were found during this study. The cosmetics manufacturer will use the information provided in this thesis in their product development.