Trikinellasekainfektioiden tunnistaminen
Huhtelin, Eeva (2012)
Oulun seudun ammattikorkeakoulu
2012
All rights reserved
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2012111915519
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2012111915519
Tiivistelmä
Tässä opinnäytetyössä tutkittiin Suomessa esiintyviä trikinellalajeja. Työn tarkoituksena oli valmistaa eri trikinellalajien toukista sekainfektioita ja tutkia, voidaanko yhden lajin toukka tunnistaa useamman erilajisen toukan seasta. Tavoitteena oli tutkia menetelmän herkkyyttä ja selvittää rajat, joiden jälkeen yksittäisen toukan havaitseminen yhteisnäytteestä ei enää onnistunut. Työ tehtiin Elintarviketurvallisuusvirasto Eviran Tuotanto- ja villieläintutkimusyksikölle.
Työ aloitettiin toukkien eristämisellä koe-eläinten lihasta. Toukat hajotettiin ja niiden DNA eristettiin. Lajintunnistus suoritettiin multiplex-PCR-menetelmällä ja PCR-reaktion tulokset todettiin agaroosigeelielektroforeesilla.
Työn edetessä havaittiin, että käytetty menetelmä ei ole luotettava sekainfektioiden tunnistamiseen useamman toukan yhteisnäytteestä. Luotettavampi tulos saadaan, kun lajintunnistus tehdään yksittäisille toukille. Tällä tavalla työhön käytettävä aika lyhenee huomattavasti, sillä useamman toukan hajottamiseen kuluu enemmän aikaa kuin yksittäisen toukan hajottamiseen.
Työ aloitettiin toukkien eristämisellä koe-eläinten lihasta. Toukat hajotettiin ja niiden DNA eristettiin. Lajintunnistus suoritettiin multiplex-PCR-menetelmällä ja PCR-reaktion tulokset todettiin agaroosigeelielektroforeesilla.
Työn edetessä havaittiin, että käytetty menetelmä ei ole luotettava sekainfektioiden tunnistamiseen useamman toukan yhteisnäytteestä. Luotettavampi tulos saadaan, kun lajintunnistus tehdään yksittäisille toukille. Tällä tavalla työhön käytettävä aika lyhenee huomattavasti, sillä useamman toukan hajottamiseen kuluu enemmän aikaa kuin yksittäisen toukan hajottamiseen.