Clostridium difficilen toksiinigeenien osoitukseen käytettävän Xpert® C.difficile -testin validointi

Abstract

Opinnäytetyön aihe saatiin Päijät-Hämeen sosiaali- ja terveysyhtymän kliinisen mikrobiologian laboratoriosta, jonne haluttiin sensitiivisempi ja nopeampi menetelmä Clostridium difficile -infektion diagnostiikkaan. Tarkoituksena oli analysoida ulostenäytteitä Xpert® C. difficile -testillä ja tutkia sen soveltuvuutta C. difficile -diagnostiikkaan. Xpert® C. difficilellä saatuja tuloksia verrattiin Immunocard® Toxins A&B -testillä sekä ulosteviljelyllä saatuihin tuloksiin. Tehtävinä oli selvittää eroaako Xpert® C. difficile -testin sensitiivisyys ja spesifisyys Immunocard® Toxins A&B-testistä ja nopeuttaako Xpert® C. difficile -testi Clostridium difficile -infektion diagnosointia.

Kokeellisessa osiossa analysoitiin 45 ulostenäytettä, joista viljelypositiivisia oli 13 ja viljelynegatiivisia 32 näytettä. Xpert® C. difficile -testi tunnisti viljelypositiivisista ulostenäytteistä 12 sekä 31 viljelynegatiivista näytettä. Lisäksi testillä saatiin yksi väärä negatiivinen ja yksi väärä positiivinen tulos. Xpert® C. difficile -testin sensitiivisyydeksi saatiin 92% ja spesifisyydeksi 97%. Immunocard® Toxins A&B -testi tunnisti kaikki viljelynegatiiviset näytteet. Testi antoi viisi väärää negatiivista tulosta, mutta ei yhtään väärää positiivista tulosta. Sen sensitiivisyydeksi saatiin 62% ja spesifisyydeksi 100%.

Xpert® C. difficile -testi osoittautui huomattavasti sensitiivisemmäksi kuin Immunocard® Toxins A&B -testi. Spesifisyyksissä ei testien välillä ollut suurta eroa. Xpert® C. difficile -testin suoritus oli yksinkertaisempi ja nopeampi kuin Immunocard® Toxins A&B -testin. Paremman sensitiivisyytensä ansiosta Xpert® C. difficile -testi nopeuttaisi C. difficile -infektion diagnostiikkaa. Xpert® C. difficile -menetelmä on kuitenkin selvästi kalliimpi kuin Immunocard® Toxins A&B -menetelmä.

Clostridium difficile is an anaerobic spore-forming bacterium. It is the most common cause of nosocomial diarrhoea in Europe and North America. The diagnosis of clostridium difficile infection (CDI) is based on the clinical symptoms of the patient and the isolation of C. difficile or its toxins from faeces. The objective of this study was to validate a new PCR-assay used for the diagnosis of CDI called Xpert® C. difficile.

The study was carried out by analysing 45 faecal samples with Xpert® C. difficile. These samples had already been analysed by using the Immunocard® Toxins A&B assay. Bacterial culture of the faecal samples was used as a reference method. The data were analysed by calculating the sensitivities and specificities of Xpert® C. difficile and Immunocard® Toxins A&B and the results were compared to each other.

The study showed that Xpert® C. difficile is a far more sensitive method than the Immunocard® Toxins A&B. The specificities of the two tests showed no significant differences. In conclusion, using Xpert® C. difficile would expedite the diagnostics of CDI.