KingFisher Flex -automaatin soveltuvuus teolliseen utaretulehdusnäytteiden eristämiseen

Abstract

KingFisher Flex on PCR-tekniikkaan kehitetty magneettipartikkeleiden avulla toimiva DNA:n eristysautomaatti. Tämä työ käsittelee automaatin beta-testausta, joka suoritettiin Valion Seinäjoen aluelaboratoriossa keväällä 2012. Beta-testauksessa eristettiin 1500 utaretulehdusnäytettä kahdella eri eristysmenetelmällä. Utaretulehdusnäytteiden eristysmenetelminä käytettiin perinteistä paljon käsityötä vaativaa menetelmää ja KingFisher Flex -automaattia. Beta-testauksen tarkoituksena oli selvittää eristysautomaatin soveltuvuutta utaretulehdusnäytteille. Samalla oli tarkoitus kartoittaa mahdollisia automaatilla saavutettavia etuja sekä menetelmän kehittämiskohteita. Automaatin tavoitteena oli nopeuttaa ja helpottaa utaretulehdusnäytteiden diagnosointia, minkä vuoksi työssä tutkitaan myös laitteen hankinnan kannattavuutta. Automaatti osoittautui laitevalmistajan väittämien mukaan tehokkaammaksi ja vaivattomammaksi eristystavaksi kuin perinteinen. Eri menetelmien tulosten välillä ei ollut merkittäviä poikkeamia, minkä vuoksi eristysautomaatin voitiin todeta soveltuvaksi myös utaretulehdusnäytteiden eristämiseen. Koska uusi eristysmenetelmä eroaa perinteisestä DNA:n eristämisestä, on menetelmään kuitenkin perehdytettävä käyttäjät hyvin luotettavien tulosten saavuttamiseksi.

KingFisher Flex is a magnetic particle processor designed to be used with PCR-technique. The thesis is based on KingFisher’s beta-testing, which was completed at Valio Seinäjoki laboratory in 2012. The beta-testing included 1500 mastitis samples. Bacteria were isolated from the samples with two different techniques. The techniques were traditional, which meant a lot of handwork, and a new KingFisher Flex -robot. In the study, KingFisher Flex was tested to mastitis samples. For Valio, it was im-portant to find out the better isolation technique and to solve if the KingFisher Flex is a good investment. A part of the thesis was collecting opinions about the robot and the new method. KingFisher flex proved to be more efficient and to use an easier method than the original method. The results between the two methods were quite similar in bacte-ria, but had differences in the isolation process. Because this new method is slightly different from the original, the users should be introduced carefully to it to get reliable results.