ABO-veriryhmän alatyyppien genotyypitysmenetelmän koestus
Pippola, Piia-Riikka; Viljanen, Asta (2014)
Pippola, Piia-Riikka
Viljanen, Asta
Metropolia Ammattikorkeakoulu
2014
All rights reserved
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2014112817340
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2014112817340
Tiivistelmä
ABO-veriryhmäjärjestelmä perustuu punasolun pinnalla oleviin antigeeneihin A ja B, niiden muodostamiin veriryhmiin A, B, AB ja O sekä plasmassa oleviin vasta-aineisiin anti-A ja anti-B. ABO-veriryhmistä tunnetaan myös alatyyppejä, jotka ovat muodostuneet, kun jokin antigeeni muuttuu geneettisesti. Alatyypit ovat populaatiosta riippuvaisia ja hankaloittavat veriryhmien serologista tunnistamista. Kun veriryhmä on epäselvä, normaalit verensiirtosäännöt eivät enää päde. Tällöin veriryhmä täytyy määrittää geenitasolla, jotta tiedetään täsmällisesti, mikä veriryhmä potilaalla on.
Opinnäytetyön tarkoituksena oli testata, soveltuuko RBC-Ready Gene ABO Subtype -reagenssipakkaus Suomen Punaisen Ristin (SPR) Veripalveluun ABO-veriryhmäjärjestelmän alatyyppien genotyypitysmenetelmäksi. Tavoitteena oli selvittää, onko menetelmä toistettava ja luotettava.
Käytännön toteutus suoritettiin SPR Veripalvelussa. EDTA-verestä eristetystä DNA:sta määritettiin tarkempi veriryhmä käyttäen Inno-Trainin RBC-Ready Gene ABO Subtype -reagenssipakkausta. Näytteitä oli kaiken kaikkiaan 26. Reagenssipakkauksen 8 näytepaikassa on jokaisessa sekvenssispesifiset alukkeet (SSP= sequence spesific primers), jotka tarttuvat tiettyihin mutaatiokohtiin DNA:ssa. DNA monistettiin polymeraasiketjureaktiolla (PCR), minkä jälkeen monistustuotteet eroteltiin geelielektroforeesilla ja värjättiin ethidiumbromidilla. Erottelun jälkeen geelit kuvattiin ultraviolettivalossa ja kuvat analysoitiin tulkintakaavion avulla.
RBC-Ready Gene ABO Subtype -menetelmä ei tunnistanut suomalaisessa väestössä yleisimmin esiintyviä ABO-veriryhmän alatyyppien mutaatioita. Reagenssipakkausta ei oteta käyttöön SPR Veripalvelussa. Epäselvien veriryhmien tutkiminen jatkuu serologisesti entiseen tapaan ainakin toistaiseksi.
Opinnäytetyön tarkoituksena oli testata, soveltuuko RBC-Ready Gene ABO Subtype -reagenssipakkaus Suomen Punaisen Ristin (SPR) Veripalveluun ABO-veriryhmäjärjestelmän alatyyppien genotyypitysmenetelmäksi. Tavoitteena oli selvittää, onko menetelmä toistettava ja luotettava.
Käytännön toteutus suoritettiin SPR Veripalvelussa. EDTA-verestä eristetystä DNA:sta määritettiin tarkempi veriryhmä käyttäen Inno-Trainin RBC-Ready Gene ABO Subtype -reagenssipakkausta. Näytteitä oli kaiken kaikkiaan 26. Reagenssipakkauksen 8 näytepaikassa on jokaisessa sekvenssispesifiset alukkeet (SSP= sequence spesific primers), jotka tarttuvat tiettyihin mutaatiokohtiin DNA:ssa. DNA monistettiin polymeraasiketjureaktiolla (PCR), minkä jälkeen monistustuotteet eroteltiin geelielektroforeesilla ja värjättiin ethidiumbromidilla. Erottelun jälkeen geelit kuvattiin ultraviolettivalossa ja kuvat analysoitiin tulkintakaavion avulla.
RBC-Ready Gene ABO Subtype -menetelmä ei tunnistanut suomalaisessa väestössä yleisimmin esiintyviä ABO-veriryhmän alatyyppien mutaatioita. Reagenssipakkausta ei oteta käyttöön SPR Veripalvelussa. Epäselvien veriryhmien tutkiminen jatkuu serologisesti entiseen tapaan ainakin toistaiseksi.