ACTINOBACULUM SCHAALII -BAKTEERIN TUNNISTAMINEN

Abstract

Actinobaculum schaalii on grampositiivinen sauvabakteeri, ja se kuuluu ihmisen normaaliflooraan. A. schaalii luokitellaan anaerobibakteeriksi, mutta sillä on mikroaerofiilisiä ominaisuuksia. Opinnäytetyön tarkoituksena oli tutkia seitsemää Actinobaculum schaalii -bakteerikantaa. Tutkimuksessa vertailtiin kyseisiä kantoja keskenään suorittamalla erilaisia mikrobiologisia tunnistustestejä ja viljeltiin kannat erilaisille elatusmaljoille. Näillä menetelmillä yritettiin löytää kannoille yhteisiä tekijöitä ja ominaisuuksia, joiden perusteella voidaan helpottaa A. schaalii -bakteerin tunnistamista kliinisen mikrobiologian laboratoriossa. Lisäksi tutkittiin, löydettäisiinkö potilaan virtsasta helpommin A. schaalii -bakteeria, jos virtsan erikoisviljely U-BaktEVi sisältäisi anaerobisille bakteereille tarkoitetun elatusmaljan. Tutkimus oli toimeksianto Itä-Suomen laboratoriokeskuksen liikelaitoskuntayhtymän, Mikkelin aluelaboratorion mikrobiologian osastolta. Tutkimusmenetelmä oli kvantitatiivinen ja koeasetelma kokeellinen.

Tutkimuksen perusteella saatiin uutta tietoa A. schaaliin ominaisuuksista ja käyttäytymisestä erilaisissa olosuhteissa, mikä voi auttaa A. schaaliin tunnistuksessa kliinisessä mikrobiologian laboratoriossa. Tutkimus oli tärkeä, koska A. schaalii -bakteeria ei ole tutkittu aikaisemmin Suomessa. Erikoistutkimusten osalta voitaisiin kehittää nykyistä BaktEVi-tutkimusta siten, että sen avulla voisi löytää A. schaaliin virtsanäytteestä ABA-viljelyn avulla. Erikoistutkimuksen kehittäminen olisi tärkeää siksi, että A. schaalii -bakteeri löydettäisiin ja tunnistettaisiin mahdollisimman varhaisessa vaiheessa.

The objective of this thesis was to examine seven bacterial strains of Actinobaculum schaalii. The purpose was to compare the strains by carrying out different types of microbiological identification tests and by culturing them on different kinds of culture media. These methods were used to find similarities between the strains and to find features which help to identify A. schaalii in the laboratories of clinical microbiology. In addition, it was studied if it were easier to find A. schaalii in the patient’s urine if a cultivation technique called U-BaktEVi contained a culture medium specific for anaerobic bacteria. The study was commissioned by the Eastern Finland Laboratory Centre Joint Authority Enterprise (ISLAB), Microbiological Department of Mikkeli Regional Laboratory. The research method was quantitative and the design experimental.

On the basis of the study, new information was gained about the features of A. schaalii and about how it acts in different environments. This may help the identification of A. schaalii in the laboratories of clinical microbiology. The study is significant because A. schaalii has not been studied before in Finland. The current cultivation technique called U-BaktEVi could be developed further. Thus, A. schaalii could be found in a urine sample if ABA cultivation were added to the current technique. It would be important to develop special cultivation techniques, such as U-BaktEVi, to find and identify A. schaalii as early as possible.