Laboratoriolaitteiden yhdistäminen pilvipalveluun
Konttila, Jonna (2025)
2025
All rights reserved. This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-202504257641
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-202504257641
Tiivistelmä
Työn tavoitteena oli toteuttaa toimiva prosessi ja kuvaus laboratoriolaitteiden yhdistämisestä sekä niiden tuottaman datan ja metadatan siirrosta pilvipalveluun. Toimeksiantajana toimi AB Enzymes Finland Oy.
Työssä käytettiin Edgeboxeiksi kutsuttuja Linux-tietokoneita, joiden avulla laboratoriolaitteita yhdistettiin Azure-pilvipalveluun. Tiedostojen siirrossa käytettiin Samba-tiedostonsiirto-ohjelmaa ja Docker-sovellusta. Digitalisaatioprojektin tavoitteena oli datan automatisointi Electronic Lab Notebook-järjestelmää (ELN) varten ja vapauttaa tutkijoiden työaikaa laboratoriotulosten kirjaamisesta ja siirtämisestä tutkimustyöhön. Työssä suunniteltiin myös Edgeboxien ylläpitoa ja monitorointia.
Työssä saatiin toimiva prosessi ja yhtenäinen tapa asentaa Edgeboxeja ja yhdistää laboratoriolaitteita niiden avulla Azure -pilvipalveluun. Tulevaisuudessa prosessiin yhdistetään vielä Laboratory Information Management System (LIMS), jossa laitteiden antamaa dataa voidaan hallita ja käsitellä.
Työssä käytettiin Edgeboxeiksi kutsuttuja Linux-tietokoneita, joiden avulla laboratoriolaitteita yhdistettiin Azure-pilvipalveluun. Tiedostojen siirrossa käytettiin Samba-tiedostonsiirto-ohjelmaa ja Docker-sovellusta. Digitalisaatioprojektin tavoitteena oli datan automatisointi Electronic Lab Notebook-järjestelmää (ELN) varten ja vapauttaa tutkijoiden työaikaa laboratoriotulosten kirjaamisesta ja siirtämisestä tutkimustyöhön. Työssä suunniteltiin myös Edgeboxien ylläpitoa ja monitorointia.
Työssä saatiin toimiva prosessi ja yhtenäinen tapa asentaa Edgeboxeja ja yhdistää laboratoriolaitteita niiden avulla Azure -pilvipalveluun. Tulevaisuudessa prosessiin yhdistetään vielä Laboratory Information Management System (LIMS), jossa laitteiden antamaa dataa voidaan hallita ja käsitellä.