Menetelmävalidointi : Abbot Allele SEQR mikrokimera

Abstract

Akuutit leukemiat ovat klonaalisia, yhdestä varhaisesta kantasolusta lähtöisin olevia pahanlaatuisia verisairauksia. Allogeenisella kantasolusiirrolla (allo-HSCT) siirteen saajam kantasolut ja koko hematopoieesi korvataan siirteen luovuttajan terveillä kantasolusiirroilla, jolloin myös pahalaatuinen veritauti voidaan parantaa pysyvästi. Allogeenisen kantasolusiirron rajoittavana tekijänä ovat kuitenkin vakavat komplikaatiot kuten graft-versus-host tauti (GvhD). Hematopoieettisten kantasolujen siirroissa tavoitteena on täydellinen luovuttajan kimerismi. Usein kuitenkin potilaan solupopulaatio korvautuu hitaasti luovuttajan soluilla ja joskus, kuten taudin relapsin yhteydessä, potilaan omien solujen osuus voi alkaa kasvaa hoidon myöhemmässä vaiheessa. Kimerismitutkimuksessa seurataan potilaan luuytimen solupopulaatioita. Tällöin mahdollinen taudin relapoituminen on ennakoitavissa ja potilaan ennustetta voidaan parantaa. Tutkimuksessa validoitiin qPCR-menetelmään perustuva kimerismianalyysi, Abbot Molecular Allele SEQR. Validoinnissa tutkittiin yhteensä yksitoista kantasolusiirteen luovuttaja ja saaja paria. Joukossa oli mukana sekä sisarluovuttajia että rekisteriluovuttajia. Uudella menetelmällä saatuja tuloksia verrattiin vanhaan käytössä olevaan menetelmään. Tuloksista pystyttiin näkemään että uusi menetelmä oli huomattavasti herkempi verrattuna vanhaan. Useiden potilaiden näytteissä oli havaittavissa erittäin pientä sekakimerismiä, kun taas vanhalla menetelmällä tulos oli täydellinen luovuttajan kimerismi.

Acute leukemias are clonal, beginning from one early stem cell, malignant blood disease. In allogeneic stem cell transplantation (allo-HSCT) the stem cells and complete hematopoiesis of the recipient is replaced byt that of the donor. This may lead to permanent cure of the haematological malignancy. However the limiting factor in Allogeneic stem cell transplantation are the serious complications such as graft-versus-host disease(GvHD). Aim of hematopoietic stem cell transplantation is complete donor chimerism. However, often the patient's entire cell population is replaced by donor cells rather slowly and the proportion of recipient cells may start to increase even in later phases of treatment. Chimerism methods monitor the origin of patient's blood or bone marrow cell populations. This way the potential relapse of the disease can be predicted and the patient's prognosis can be improved. This study was executed to validate a qPCR method based chimerism analysis Abbot Allele SEQR. A total of eleven donor and recipient pairs were studied for this validation. The samples included both sibling and unrelated matched donors. Results by the new method were compared to the old method previously used. Results suggested that the new method was significantly more sensitive than the old. Many patients samples showed very low mixed chimerism by Allele SEQR, whereas with the old method, the result was a complete donor chimerism.