Kalprotektiini : Ulostenäytteen esikäsittelyn koestus Fimlab Laboratoriot Oy:ssä

Abstract

Kroonisiin tulehduksellisiin suolistosairauksiin (inflammatory bowel disease, IBD) kuuluvat Crohnin tauti, Colitis ulcerosa eli haavainen koliitti sekä mikroskooppinen koliitti. Kalprotektiinin määrityksellä krooniset tulehdukselliset suolistosairaudet erotetaan ärtyvän suolen oireyhtymästä eli IBS:stä (irritable bowel syndrome). Ulosteen kalprotektiinin määritys on tärkeä suolistotulehduksen mittari, tulehduksen aktiivisuuden osoittaja sekä hyödyllinen tulehduksellisen suolistosairauden hoidon seurannassa.

Aihe opinnäytetyölle saatiin Fimlab Laboratoriot Oy:n mikrobiologian vastuualueen osastonylilääkäri Anna-Maija Haapalalta. Tarkoituksena oli koestaa ulosteen esikäsittelyn toimivuus kalprotektiinimäärityksissä vertaamalla kahta menetelmää, EliA Stool Extraction Kit ja Faecal Sample Preparation Kit by Roche Diagnostics. Työssä selvitettiin, kumpi esikäsittelymenetelmistä sopi paremmin käytännön työhön ja kuinka esikäsitelty näyteseos säilyi huoneenlämmössä, jääkaappilämpötilassa sekä pakastettuna. Esikäsiteltäviä näytteitä oli yhteensä 36 kappaletta. Työn tavoitteena oli tuottaa tietoa, jota apuna käyttäen ulosteen kalprotektiinitutkimus voidaan ottaa määritettäväksi Fimlab Laboratoriot Oy:ssä ja luopua alihankinnasta. Opinnäytetyö oli kokeellinen tutkimus sisältäen piirteitä sekä kvalitatiivisesta että kvantitatiivisesta tutkimuksesta.

Esikäsittelymenetelmiä vertailtiin kriteerein, jotka olivat esikäsittelyyn kuluva aika, hinta, syntyneet jätteet sekä työturvallisuus. Koestuksen pohjalta ei kuitenkaan pystytty sanomaan kummankaan menetelmän olevan toista ehdottomasti parempi. Tulokset säilyvyydestä osoittivat, että näytteet tulisi määrittää mahdollisimman pian esikäsittelystä. Vertailtaessa tuloksia alihankintalaboratorion saamiin tuloksiin huomattiin menetelmällisiä eroja.

Chronic inflammatory intestinal diseases (inflammatory bowel disease, IBD) include Crohn´s disease, colitis ulcerosa, and microscopic colitis. Inflammatory bowel disease is separated from irritable bowel syndrome with calprotectin measurement. Faecal calpro-tectin is a significant marker to indicate inflammation, as well as a useful indicator of treatment follow-up.

The topic for our study was suggested by Fimlab Medical Laboratories Ltd. The purpose of this study was to compare two preparation methods, which were EliA Stool Ex-traction Kit and Faecal Sample Preparation Kit by Roche Diagnostics. The purpose was also to test which preparation method is better suited for practice and how faecal calpro-tectin extract keeps in different temperatures. The objective of this study was to provide useful information to Fimlab Medical Laboratories Ltd in order to analyze calprotectin measurement, and evaluate the need of subcontracting.

Our experimental study had characteristics of qualitative and quantitative research. Our role was to prepare 36 stool samples for calprotectin measurement. The criteria used as comparison methods were time, cost of the preparation, waste and the occupational safety. When results were compared, it was found that there are differences between the methods used in this study, and the methods used by the subcontracting laboratory. From the perspective of the results, it cannot be stated whether any preparation method would be absolutely better. Preservation results indicate that prepared samples should be measured as soon as possible