Utaretulehdusta aiheuttavan Streptococcus agalactiae -bakteerin kartoitusnäytteiden PCR-analysoinnin optimointi

Abstract

Utaretulehdus on yleisin ja taloudellisesti merkittävin sairaus lypsylehmillä. On tärkeää, että lypsylehmien utaretulehdus ja sen aiheuttaja tunnistetaan nopeasti, jotta sairastuneet yksilöt saavat nopeasti kohdennettua hoitoa.

Str. agalactiae on utaretulehdusta aiheuttava bakteeri, joka tarttuu todella herkästi lypsykarjassa. Bakteeri aiheuttaa yleensä kroonista ja pitkäkestoista tulehdusta. Str. agalactiae on ainut utaretulehduksen aiheuttaja, jonka piilevän muodon hoidon on todettu olevan taloudellisesti kannattavaa lypsykauden aikana. Str. agalactiae -tartunnan toteaminen on hyvin tärkeää, jotta uudet tartunnat voidaan ennaltaehkäistä mahdollisimman tehokkaasti.

Str. agalactiae -bakteerin hävittäminen karjasta perustuu karjan yhtäaikaiseen tutkimukseen PCR-analyysilla. Menetelmä on käytössä Valio Oy:n utaretulehduslaboratoriossa, jonne tutkimus tehdään. Kartoituksissa karjan lehmien näytteet yhdistetään kymmenen näytteen koonneiksi, jotka tutkitaan. Jos koonnista löytyy kyseistä bakteeria, jokainen näyte tutkitaan yksittäin.

Työn tarkoituksena oli selvittää, tunnistetaanko jokainen Str. agalactiae -tapaus käytössä olevalla kymmenen koonnin menettelyllä vai jääkö osa tapauksista tunnistamatta. Samalla suoritettiin käyttöönottotestaus Major-4.2 kitille, jota voidaan mahdollisesti tulevaisuudessa käyttää Str. agalactiae kartoitusten analysoinnissa.

Tutkimuksessa selvisi, että koontinäytteet jättivät Str. agalactiae -bakteeria sisältämiä näytteitä tunnistamatta. Näytteiden yksittäin analysointi parantaa heikkojen positiivisten näytteiden tunnistamista. Major-4.2 kitistä todettiin olevan hyötyä, se on ajankäytöllisesti tehokkaampi ratkaisu, kun halutaan selvittää ainoastaan Str. agalactiae -bakteerin esiintyvyyttä näytteissä.

Opinnäytetyössä ei mainita tutkimusaineistoon kerättyjen maitonäytteiden tuottaja- tai lehmäkohtaisia tietoja.