Tutkimuspalvelulaboratorion näytehallinnan kehittäminen
Virtanen, Eveliina (2023)
Virtanen, Eveliina
2023
All rights reserved. This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2023051912162
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2023051912162
Tiivistelmä
Opinnäytetyön tavoitteena on kehittää palvelulaboratorioon tulevien näytteiden kirjaamiseen ja säilytykseen liittyviä vaiheita niin, että käytännöt ja ohjeet ovat standardin SFS-EN ISO/IEC 17025:2017 mukaisia sekä soveltuvat koko ajan kasvaviin näytemääriin.
Työssä on selvitetty ensin laatujärjestelmän perusperiaatteita, Lean-ajattelun soveltuvuutta tutkimuspalveluja tarjoavaan laboratorioon sekä standardin mukaisia näytehallinnan vaatimuksia prosessin eri vaiheissa. Prosessin kehitettäviä vaiheita olivat näytteiden vastaanottaminen, projektien näytehallinta sekä näytteiden säilytys ja hävitys. Tavoitteena oli luoda selkeät yhtenäiset käytännöt näytteiden kirjaamiseen ja merkitsemiseen sekä kehittää pakastimien sisällönhallintaa ja parantaa näytteiden jäljitettävyyttä. Jatkuvasti kasvavien näytemäärien myötä tehtiin myös kartoitus laboratorioon tarkoitetusta merkintävälineistä ja ohjelmistoista, jotka helpottaisivat näytteiden ja projektien kokonaisuuden hallintaa laboratoriossa.
NGS-tutkimuspalvelulaboratorion näytehallinnan prosessi ja kokonaisuus havainnollistettiin ensin kaaviokuvan avulla, jonka perusteella kohtakohdalta kehitettiin tutkimuspalvelunäytteiden säilytys- ja hävityskäytäntöjä laboratoriossa. Näytehallinnan kokonaisuuteen ja NGS-laboratorioon soveltuvia kaupallisesti saatavilla olevia LIMS-järjestelmiä kartoitettiin. Varsinaista testausta ei tehty tämän opinnäytetyön puitteissa, mutta löydöksistä koostettiin suositukset tutkimuspalvelulaboratorion tarpeisiin vastaavista kaupallisista LIMS-järjestelmistä tarkempaa tarkastelua varten. Näytteiden merkintätapoja kehitettiin hyödyntämällä olemassa olevia tulostimia ja yhtenäistämällä kirjaamiskäytäntöjä huomioimalla näytteen jäljitettävyys ja yksilöllinen nimeäminen sekä mahdollinen myöhemmin hankittava näytehallintajärjestelmä. Lean-ajattelun mukaisia menetelmiä hyödynnettiin laboratorion käytännön työssä näytteiden merkitsemiseen ja visuaaliseen tunnistamiseen.
Opinnäytetyön myötä laboratorion näytehallintaa kehitettiin kokonaisvaltaisesti ja toimintatapoja yhtenäistettiin standardin SFS-EN ISO/IEC 17025:2017 vaatimusten mukaisesti. Kehitystoimenpiteet tukevat hyvin laboratorion toimintoja ja henkilökunnan työtehtäviä näytemäärien jatkuvasti kasvaessa. Lisäksi saatiin tarpeellista tietoa sähköisen näytehallintajärjestelmän testauksen aloittamiseen.
Työssä on selvitetty ensin laatujärjestelmän perusperiaatteita, Lean-ajattelun soveltuvuutta tutkimuspalveluja tarjoavaan laboratorioon sekä standardin mukaisia näytehallinnan vaatimuksia prosessin eri vaiheissa. Prosessin kehitettäviä vaiheita olivat näytteiden vastaanottaminen, projektien näytehallinta sekä näytteiden säilytys ja hävitys. Tavoitteena oli luoda selkeät yhtenäiset käytännöt näytteiden kirjaamiseen ja merkitsemiseen sekä kehittää pakastimien sisällönhallintaa ja parantaa näytteiden jäljitettävyyttä. Jatkuvasti kasvavien näytemäärien myötä tehtiin myös kartoitus laboratorioon tarkoitetusta merkintävälineistä ja ohjelmistoista, jotka helpottaisivat näytteiden ja projektien kokonaisuuden hallintaa laboratoriossa.
NGS-tutkimuspalvelulaboratorion näytehallinnan prosessi ja kokonaisuus havainnollistettiin ensin kaaviokuvan avulla, jonka perusteella kohtakohdalta kehitettiin tutkimuspalvelunäytteiden säilytys- ja hävityskäytäntöjä laboratoriossa. Näytehallinnan kokonaisuuteen ja NGS-laboratorioon soveltuvia kaupallisesti saatavilla olevia LIMS-järjestelmiä kartoitettiin. Varsinaista testausta ei tehty tämän opinnäytetyön puitteissa, mutta löydöksistä koostettiin suositukset tutkimuspalvelulaboratorion tarpeisiin vastaavista kaupallisista LIMS-järjestelmistä tarkempaa tarkastelua varten. Näytteiden merkintätapoja kehitettiin hyödyntämällä olemassa olevia tulostimia ja yhtenäistämällä kirjaamiskäytäntöjä huomioimalla näytteen jäljitettävyys ja yksilöllinen nimeäminen sekä mahdollinen myöhemmin hankittava näytehallintajärjestelmä. Lean-ajattelun mukaisia menetelmiä hyödynnettiin laboratorion käytännön työssä näytteiden merkitsemiseen ja visuaaliseen tunnistamiseen.
Opinnäytetyön myötä laboratorion näytehallintaa kehitettiin kokonaisvaltaisesti ja toimintatapoja yhtenäistettiin standardin SFS-EN ISO/IEC 17025:2017 vaatimusten mukaisesti. Kehitystoimenpiteet tukevat hyvin laboratorion toimintoja ja henkilökunnan työtehtäviä näytemäärien jatkuvasti kasvaessa. Lisäksi saatiin tarpeellista tietoa sähköisen näytehallintajärjestelmän testauksen aloittamiseen.