Hyppää sisältöön
    • Suomeksi
    • På svenska
    • In English
  • Suomi
  • Svenska
  • English
  • Kirjaudu
Hakuohjeet
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.
Näytä viite 
  •   Ammattikorkeakoulut
  • Tampereen ammattikorkeakoulu
  • Opinnäytetyöt (Avoin kokoelma)
  • Näytä viite
  •   Ammattikorkeakoulut
  • Tampereen ammattikorkeakoulu
  • Opinnäytetyöt (Avoin kokoelma)
  • Näytä viite

Dermatofyytti-PCR-menetelmän verifiointi

Rapo, Jenni (2023)

 
Avaa tiedosto
Rapo_Jenni.pdf (1.194Mt)
Lataukset: 


Rapo, Jenni
2023
All rights reserved. This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Näytä kaikki kuvailutiedot
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2023111930051
Tiivistelmä
Dermatofyytit aiheuttavat valtaosan ihon, hiusten ja kynsien sieni-infektioista. Sieniviljely on tutkimuksena tarkka, mutta aikaa vievä ja siihen liittyy korkea väärän negatiivisen vastauksen riski. Pintasieninäytteiden nukleiinihappotutkimuksella pystytään osoittamaan sienten nukleiinihappoa suoraan näytteestä sieniviljelyä nopeammin ja herkemmin. Tässä opinnäytetyössä pintasienien PCR-tutkimus suoritettiin Seegenen NovaplexTM Dermatophyte Assay -menetelmällä.

Opinnäytetyön tarkoituksena on verifioida dermatofyytti-PCR-tutkimus mikrobiologian laboratorion käyttöön. PCR-tutkimusta verrataan nyt käytössä olevaan viljelyyn ja suoraan värjäykseen perustuvaan menetelmään. Opinnäytetyössä selvitetään myös, kuinka PCR-tutkimuksen käyttö vaikuttaa vastausviiveeseen pintasieninäytteiden diagnostiikassa. Käytetty tutkimusmenetelmä on kvantitatiivinen ja tulosten analysointi tapahtui IBM SPSS Statistics Data Editor -ohjelmaa käyttäen.

Tässä tutkimuksessa näytteistä 86,1% (n=68) oli värjäyspositiivisia, viljelypositiivisia oli 65,8% (n=52) ja PCR-tutkimuksessa positiivisia näytteitä oli 79,7% (n=63). Kun dermatofyytti-PCR-tutkimusta verrattiin sieniviljelyyn, oli PCR-tutkimuksen herkkyys 84,6% ja tarkkuus 29,6%. PCR-tutkimuksen herkkyys oli 84,7% ja tarkkuus 71,4%, kun vertailu tehtiin sekä sieniviljelyyn että -värjäykseen. PCR-tulos saatiin tässä tutkimuksessa keskimäärin 10,0 vuorokaudessa, kun viljelytuloksen osalta vastaus saatiin 23,2 vuorokaudessa. Ero PCR-tutkimukseen ja viljelyyn kuluneessa ajassa on tilastollisesti erittäin merkitsevä (p= <,001).

Dermatofyytti-PCR parantaa saatujen tulosten perusteella pintasieninäytteiden diagnostiikkaa, koska tutkimus on viljelyyn verrattuna herkempi, tarkempi ja nopeampi. Tämän tutkimuksen perusteella dermatofyytti-PCR-tutkimus soveltuu pintasienidiagnostiikkaan Fimlab mikrobiologian sienilaboratoriossa. Jatkotutkimusaiheena voisi selvittää asiakaskokemuksia PCR-menetelmän tuomista hyödyistä pintasienidiagnostiikassa ja mahdollistaako uusi menetelmä esimerkiksi suurempien näytemäärien käsittelyn viljelymenetelmään verrattuna.
 
Kokoelmat
  • Opinnäytetyöt (Avoin kokoelma)
Ammattikorkeakoulujen opinnäytetyöt ja julkaisut
Yhteydenotto | Tietoa käyttöoikeuksista | Tietosuojailmoitus | Saavutettavuusseloste
 

Selaa kokoelmaa

NimekkeetTekijätJulkaisuajatKoulutusalatAsiasanatUusimmatKokoelmat

Henkilökunnalle

Ammattikorkeakoulujen opinnäytetyöt ja julkaisut
Yhteydenotto | Tietoa käyttöoikeuksista | Tietosuojailmoitus | Saavutettavuusseloste