PCR-menetelmien vertailu mastiitin määrityksessä

Abstract

Opinnäytetyössä keskityttiin mastiitin eli utaretulehduksen tutkimusmenetelmiin. Tavoitteena oli vähentää negatiivisten tulosten määrä sekä vertailla eri menetelmien eroavaisuuksia. Työn tavoitteena oli selvittää mahdollisuutta vaihtaa nykyisin käytössä olevaa polymeraasiketjureaktio (PCR) -pohjaista utaretulehduksen aiheuttajamikrobin tunnistusmenetelmää toiseen kaupalliseen menetelmään ja verifioida toinen kaupallinen tunnistusmenetelmä. Negatiiviset tulokset ovat lisääntyneet nykyisellä menetelmällä ja haluttiin selvittää miten siihen saisi muutoksen ja havaitseeko toinen menetelmä tulehdusta aiheuttavia mikrobeja herkemmin. Työssä testattiin nykyisen menetelmän optimointia parempien tulosten saamiseksi sekä testattiin uutta menetelmää ja vertailtiin näiden tuloksia keskenään. Näytteiden testaus perustuu polymeraasiketjureaktioon. Näytteet eristettiin, jonka jälkeen ne valmisteltiin menetelmän mukaisesti PCR-ajoa varten. Ajon jälkeen tulokset analysoitiin ja vertailtiin keskenään. Työ sisältää liike- ja ammattisalaisuuksia.