Harvinaisten perinnöllisten sairauksien laboratoriodiagnostiikka : B-DNA-mut-tutkimusnimikkeellä tehdyt lähetteet Fimlab Laboratoriot Oy:n genetiikan laboratoriossa vuosina 2013 ja 2014

Abstract

Mutaatio on periytyvä muutos yksilön perimässä. Muutos geenissä ei ole useimmiten patologinen, eikä aiheuta yksilölle terveydellisiä ongelmia. Osa mutaatioista kuitenkin voi aiheuttaa yksilön sairastumisen. Geenitestejä voidaan käyttää esimerkiksi sairauden etiologian selvittelyyn tai sairastumisriskin arviointiin. Geenimutaatioiden diagnostiikka ja oikean geenitestin valinta voi olla haastavaa periytyvien sairauksien suuren määrän takia.

Mutaatiotutkimuksia käytetään niiden potilaiden kohdalla, joilla epäillään olevan jokin mutaatioista johtuva sairaus tai kun potilaan epäillään perineen patologisen mutaation vanhemmiltaan. Erilaisten sairauksiin johtavien mutaatioiden suuren määrän takia jokaiselle mutaatiotutkimukselle ei ole ollut mielekästä perustaa omaa tutkimusnimikettä. Fimlab Laboratoriot Oy:n B-DNAmut-tutkimusnimikettä käytetään niiden tutkimuksien yhteydessä, joille ei ole omaa määrättyä nimikettä. Tämä opinnäytetyö käsittelee B-DNAmut-nimikkeellä tilattuja tutkimuksia. Opinnäytetyön tavoitteena on tilastoinnin kautta tuottaa B-DNAmut-tutkimuksista tietoa Fimlab Laboratoriot Oy:n tarpeisiin. Työn aihe saatiin Fimlab Laboratoriot Oy:n genetiikan laboratorion sairaalageneetikko Ritva Karhulta. Työ on kvantitatiivinen opinnäytetyö ja menetelmänä käytettiin kuvailevaa tilastoanalyysia.

Tilastoa varten kerättiin tiedot 1005 pyydetystä B-DNAmut-tutkimuksesta. Jokaisesta pyynnöstä kirjattiin ylös pyytävä yksikkö, valmistumisaika, pyydettävä tutkimus ja geenit, joihin tutkimus kohdistuu, käytetty menetelmä, tutkimusindikaatio ja analyysin suorituspaikka.

Tuloksista selvisivät muun muassa eniten tutkimuksia tilaavat Tampereen yliopistollisen sairaalan yksiköt, valmistumisaikojen suuri vaihteluväli ja neurologisten sairauksien suuri osuus kaikista tutkimuksista. Jatkotutkimuksena voitaisiin esimerkiksi selvittää mutaatiotutkimusten taloudellista vaikutusta tai tutkia tutkimusnimikkeen käyttöä jonkin tietyn sairausryhmän, kuten neurologisten sairauksien, kohdalla.

Mutation tests are used in diagnostics of patients who are believed to have a disease caused by known mutation. It is not reasonable to establish a separate test label for every test because of a large number of mutations and known genetic disorders.

B-DNAmut is a test label used when requested test has no label of its own. This study explores the usage of B-DNAmut test label and the information was gathered to a Microsoft Excel sheet. The topic for this bachelor’s thesis was provided by the Laboratory of Genetics of Fimlab Medical Laboratories Ltd. The information for this study was collected from B-DNAmut test label referrals. This study is quantitative. Descriptive statistics methods were used to analyze the gathered information.

The sample of the study consisted of 1005 patient cases and was processed in statistics. The study covers year 2013 and year 2014 partially. From the sheet it can be found which units referred patients and which indications were used among other variables. For example, the result showed which units of Tampere University Hospital requested most tests and that a great percentage of tests related to neurological diseases.

The statistics can be used for further studies to explore the usage of specific indications or for financial studies of the use of the B-DNAmut test label.