Holsteinin haitalliset haplotyypit

Abstract

Geenitutkimuksen kehittymisen ja genomitestauksen yleistymisen myötä holstein-rodulta on pystytty paikallistamaan monia erilaisia haplotyyppejä. Haplotyyppi tarkoittaa yhden tai useamman alleelin ryhmää, jotka periytyvät aina yhdessä. Haplotyypit periytyvät resessiivisesti eli haitallisten haplotyyppien ei-toivotut vaikutukset tulevat ilmi vasta, jos hedelmöittymisessä syntyvä alkio perii saman haplotyypin molemmilta vanhemmiltaan. Haitalliset haplotyypit aiheuttavat pahimmillaan luomisia ja vasikoille tappavan kolesterolin imeytymishäiriön. Haplotyyppien kantajat voidaan selvittää varmaksi vain eläimestä tehtävän genomitestin avulla.

Työn tavoitteena oli kerätä tietoa holsteinin haitallisista haplotyypeistä. Kirjallisuuskatsauksessa käsiteltiin haplotyyppien periytymistä, erilaisten haitallisten haplotyyppien vaikutuksia sekä kuinka voi selvittää kantaako lehmä tai keinosiemennyssonni haitallista haplotyyppiä. Opinnäytetyön tavoitteena oli myös selvittää keinot, joilla haplotyyppien aiheuttamat haitat voidaan välttää mahdollisimman helposti ja järkevästi.

Opinnäytetyössä tehtiin maidontuottajille kyselytutkimus, jonka tavoitteena oli selvittää, kuinka monet maidontuottajat ovat kuulleet holsteinin haplotyypeistä ja ollaanko niistä ylipäätään kiinnostuneita. Kysely järjestettiin Sarka-messuilla 2. ̶ 3.2.2018 työn toimeksiantajan, HH Embryo Oy:n, osastolla. Käyttökelpoisia vastauksia kyselyyn tuli yhteensä 138, jotka analysoitiin Webropolin avulla. Kyselyn mukaan puolet maidontuottajista oli kuullut holsteinin haplotyypeistä, ja 22 prosentilla vastaajista se oli vaikuttanut heidän tilallansa tehtyihin sonnivalintoihin. Kyselyyn vastanneista 56 prosenttia oli kiinnostunut saamaan lisätietoa aiheesta.

Lisäksi opinnäytetyössä tehtiin haastatteluja jalostussuunnittelua tekeville tahoille ja maidontuottajille. Jalostusasiantuntijoiden haastatteluilla oli tarkoitus selvittää, kuinka haplotyypit huomioidaan jalostussuunnittelua tehdessä. Osa jalostussuunnitteluohjelmista huomioi haitalliset haplotyypit, osa ei. Maidontuottajien haastattelussa oli tavoitteena selvittää tarkemmin, mitä holsteinin haplotyypeistä ajatellaan ja onko tilatasolla havaittu mahdollisesti haplotyypeistä johtuvia haitallisia vaikutuksia.

Yli puolet kyselyyn vastanneista oli kiinnostuneita saamaan lisää tietoa holsteinin haitallisista haplotyypeistä, joten työhön kerätylle tiedolle on tarvetta. Lisäksi maidontuottajien tietoisuutta haitallisista haplotyypeistä on hyvä lisätä, koska haplotyyppien haitallisten vaikutusten välttäminen on helppoa, kun aiheesta vain on tietoa. Työn jatkokehitysidea on tutkia muiden lypsykarjarotujen haitallisten haplotyyppien vaikutuksia. Mielenkiintoista olisi myös selvittää, kuinka paljon Suomen holstein-populaatiossa on todellisuudessa haitallisten haplotyyppien kantajia.

Due to the development of genetic research and the genomic testing, Holstein has been able to locate many different haplotypes. A haplotype is an allele or a group of alleles located close to each other and which are inherited together. Haplotypes are inherited recessively, i.e. the haplotypes have an effect only when an animal inherits the same version of the gene from each parent. In the worst case, the haplotype can cause stillbirths for pregnant cows or mortal cholesterol deficiency for calves. Carriers of the haplotypes can be solved only for sure by the genome analysis.

The aim of this study was to describe harmful haplotypes in Holsten breed. The literature review describes the inherited of haplotypes, effects of haplotypes and how to know if a cow or a sire is a carrier of the haplotype. Also the aim of this study was to find out how the haplotypes can be avoided as easily and rationally as possible.

The study involved a survey of dairy farmers. The aim of the survey was to report how often dairy farmers have heard about Holstein haplotypes and whether they are interested in them. The client organization of this study is HH Embryo Oy. The survey was held at the Sarka-fair on the 2.-3. of February 2018 at the client organization’s stand. A total of 138 responses to the survey were analyzed by using Webropol. The study results revealed that half of the respondents had heard about Holstein’s haplotypes and 22 percent of respondents had noticed haplotypes while choosing artificial insemination bulls to their herd. 56 percent of respondents were interested in getting more information on this topic.

In addition, there are theme interviews of breeding experts and dairyfarmers in this study. The aim of interviews of breeding experts was to find out how they notice harmful haplotypes while making breeding programs to farms. Some of the breeding programs consider harmful haplotypes, some do not. The aim of the theme interviews to dairy farmers was to find out what farmers think about harmful haplotypes in Holstein breed.

More than half of respondents were interested in getting more information on harmful haplotypes in Holstein, so there is a need for the study. In addition, it is good to grow dairyfarmers awereness besides to haplotypes, as avoiding the harmful effects of haplotypes is quite easy if there is knowledge about the topic. A topic for further study is to research the effects of the harmful haplotypes of other dairy cow breeds. It would also be interesting to find out the frequency of harmful haplotypes in Holstein population in Finland.