QPCR-menetelmän tuoma lisäarvo kuntotutkimuksissa

Abstract

Perinteisten viljelymenetelmien rinnalle rakennusmateriaalien mikrobikasvuston todentamiseen on kehitetty kvantitatiivinen qPCR-menetelmä, joka perustuu perimäaineksen eli DNA:n määritykseen. Menetelmää käytetään nykyisin yhä enenevissä määrin kosteus- ja homevauriodiagnostisena välineenä. Määrityksessä qPCR-menetelmä osoittaa sekä elävät että kuolleet/viljelykelvottomat mikrobisolut näytteestä, kun taas viljelymenetelmillä saadaan vain elävät mikrobit tunnistettua. Lisäksi menetelmä on viljelyyn verrattuna nopea, sillä analyysitulos valmistuu muutamassa tunnissa. QPCR-menetelmällä on huomattavia etuja verrattuna perinteisiin viljely- ja kasvatusmenetelmiin, joita tässä opinnäytetyössä käsitellään tarkemmin. Opinnäytetyön tavoitteena oli selvittää Sitowise Oy:n kuntotutkimusaineiston perusteella qPCR-menetelmän tuomaa lisäarvoa kuntotutkimuksissa. Opinnäytetyön aineistoksi valikoitiin ne kohteet, joissa oli käytetty viljely- ja qPCR-menetelmiä rinnakkain. Aineistosta laadittiin yhteenveto ja kooste qPCR-menetelmän eduista ja kerättiin yhteen hyödyllistä tietoa seuraavia tutkimuksia varten. Tiedon kerääminen ja aiheeseen tutustuminen aloitettiin kuntotutkimustehtävissä kohteessa kesällä 2017, jolloin otettiin viljely- ja qPCR-näytteitä. Näytteitä otettiin kohteessa pätevän tutkijan opastuksella. Aiheeseen perehdyttiin tutustumalla yrityksen kuntotutkimusraporttien lisäksi aiheesta löytyviin mikrobiologisiin oppaisiin, ohjeisiin ja alalla toimivien yritysten julkaisuihin. Tässä työssä lähtötietoina käytettävien kohteiden kuntotutkimusten ja niistä laadittuihin sisäilma- ja kuntotutkimusraportteihin perehtymisen myötä todettiin, että qPCR-menetelmällä on ollut merkittävä lisäarvo kohteiden mikrobivaurioiden selvitystyössä. Opinnäytetyössä kerätyn aineiston avulla saatiin tutkijoille laadittua viljely- ja qPCR-menetelmillä tehdyistä tutkimuksista hyvä työkalu, josta tulokset löytyvät kootusti ja jota voi hyödyntää seuraavissa kuntotutkimuksissa.

Quantitative qPCR method has been developed for the verification of the microbial growth in building materials, based on the determination of the genetic material DNA. The method is used as a diagnostic tool for moisture and mold damage. QPCR assay method can detect both live and dead microbial cells from the sample, while culture methods can only detect living microbes. Furthermore, this method is fast compared to cultivation, because the analysis is completed in a few hours. The qPCR method has considerable advantages over traditional cultivation and breeding methods that are discussed in more details in this thesis. The aim of the thesis was to investigate whether the qPCR method provides added value to condition surveys of buildings the study is based on Sitowise OY’s condition surveys materials. The sample material for this thesis was selected from the subjects where the cultivation and qPCR methods were used in parallel. A summary of the research and the benefits of the qPCR method were compiled, and useful information was collected for the following investigation. The subject became familiar by reviewing the microbiological guides, guidelines and publications of active companies in the field. Data collection and getting to know the topic was started in condition survey tasks in the summer of 2017, when the cultivation and qPCR samples were taken, together with a qualified researcher. Based on the studies and the reports used in this work, it was found that the qPCR method has been a significant added value in the investigation of microbial damage of the buildings.