DNA-taltiointivälineiden vertailu

Abstract

Opinnäytetyö tehtiin Keskusrikospoliisin Rikosteknisen laboratorion DNA-laboratoriossa Vantaan Jokiniemessä. Opinnäytetyön tarkoituksena oli testata uusia DNA-näytteiden taltiointivälineitä ja verrata niitä nykyisin käytössä olevaan pumpulipuikkoon. Tavoitteena oli testata, onko markkinoilla tällä hetkellä saatavilla tehokkaampia taltiointivälineitä, joilla taltioinnin pystyisi suorittamaan yksinkertaisemmin ja nopeammin.

Testaukseen valittiin kaksi taltiointiteippiä sekä erilaisia katkaistavia taltiointipuikkoja. Taltiointivälineitä verrattiin taltioimalla DNA-näytteitä erilaisilta näytemateriaaleilta. DNA- näytteistä määritettyjen totaali-DNA-määrien sekä STR-DNA-tunnisteiden avulla pystyttiin vertailemaan eri taltiointivälineiden soveltuvuutta DNA-laboratoriossa käytetyille menetelmille. Teippitestauksessa näytemateriaalina oli käytettyjä t-paitoja ja taltiointipuikkojen testauksessa käytettiin kosketusnäytteitä eri tyyppisiltä näytemateriaaleilta. Näytemateriaaleihin pyrittiin saamaan toistettava määrä DNA:ta, jotta taltiointivälineitä pystyttiin vertailemaan keskenään. Kosketusnäytteet osoittautuivat erityisen haasteelliseksi toteuttaa toistettavasti, koska henkilöistä tapahtuvaan DNA:n irtoamiseen ei voida juuri vaikuttaa. Taltiointipuikkoja testattiin myös suun epiteelisoluista valmistetun epiteelisuspension saantokokeilla. Saantokokeiden avulla saatiin vertailukelpoisia tuloksia eri taltiointipuikoille.

Teippitestauksessa verrattavien teippien q-PCR-menetelmällä määritetyt DNA-määrät eivät eronneet merkittävästi käytössä olevalla pumpulipuikolla saaduista tuloksista. Teippien käytettävyydessä sen sijaan havaittiin joitakin eroja verrattuna pumpulipuikkoon ja STR- DNA-tunnisteita vertailemalla havaittiin, että toisella teipeistä tunnisteet olivat vahvempia kuin pumpulipuikoilla. Taltiointipuikkojen testauksessa q-PCR-menetelmällä määritettyjen totaali-DNA-määrien avulla havaittiin, että eri välineiden tuloksissa oli eroa, mutta tulokset olivat yhtä hyviä kuin nykyisellä pumpulipuikolla saadut tulokset. Epiteelilaimennossarjan tuloksien perusteella ei pystytty osoittamaan eroja taltiointipuikkojen tulosten välillä. Käyttömukavuuden ja DNA-tunnisteiden vertailussa kuitenkin havaittiin, että yksi vertailuun valituista taltiointipuikoista soveltuisi näytetaltiointiin jopa paremmin kuin tällä hetkellä käytössä oleva pumpulipuikko.

The Bachelor's thesis work was conducted in the National Bureau of Investigation in Vantaa, Jokiniemi. The aim of this thesis work was to test new DNA sampling devices (DSV), comparing them to the DNA-rayon swabs that are in use nowadays. The goal was to find a new DSV that is simple and easy to use in DNA sampling.

Two DNA tapes and different swab models were chosen for comparison. The suitability of different DSVs for the methods used in DNA laboratory was compared by analyzing STR- profiles and measuring total-DNA amounts. Tests were conducted with two DNA tapes using tape-lifting method from worn t-shirts. Swab test was conducted using different materials for touch DNA sample recovery. Touch DNA samples proved to be the most challenging to accomplish repeatedly because the amount of DNA that people shed cannot be controlled. Swabs were also tested with yield experiment of epithelial cell suspension made from mouth epithelial cells. Yield experiment was made in order to get comparable results for the swabs.

The total DNA amounts of tapes were compared to now used swab and they were analyzed with qPCR method. Analysis showed that there was no significant difference between the results of tapes and used swab. Instead, there was some difference in the usability of the tapes compared to the used swab. Also, the STR-DNA profile comparison showed some differences in profiles of tapes and the used swab, and the DNA profiles of one of the tapes were slightly better than the profile of the used swab. The total DNA amounts of different swabs were analyzed with qPCR method. Comparison of the results showed that there were differences between swab results, but the results were as good as the results of used swab. The series of epithelial cell suspension dilutions showed that there was no significant difference between the swab results. However, the comparison of usability and the analysis of STR-DNA profiles showed that one of the tested swabs was even better than the one that is in use at the moment.