Geenien ekspressiotasojen mittausmenetelmät

Abstract

Opinnäytetyön alkuperäisenä tarkoituksena oli ottaa käyttöön ja testata lähetti-RNA-tasojen mittauksiin soveltuva Transcript Analysis with the aid of Affinity Capture (TRAC) -menetelmä Oulun yliopiston bioprosessitekniikan laboratoriossa, sekä laatia selkeät englanninkieliset käyttöohjeet TRAC-mittauksia varten. Erinäisistä viivästyksistä johtuen työn aiheeksi kuitenkin valikoitui kirjallinen selostus erilaisista geenien ekspressiotasojen mittaus menetelmistä.

Opinnäytetyössä käyn läpi joitakin yleisimmin käytössä olevia geenien ekspressiotasojen mittausmenetelmiä ja näiden uusimpia sovelluksia bioprosessitekniikassa. Läpikäydyt menetelmät käsittävät ekspressiotasojen mittausmenetelmät perinteisistä hybridisaatio-, Northern-blot ja in situ-, liuoshybridisaatio menetelmistä ja sen sovelluksiin aina geenisiruihin asti.

TRAC-mittauksia varten ehdin tehdä RNA-eristyksiä Pichia pastoris -hiivan soluista, mitkä myös on otettu mukaan opinnäytetyöhön.