Kampylobakteerien diversiteetin määritys naudan maksasta reaaliaikaisella PCR-menetelmällä
Tuononen, Jenna (2020)
2020
All rights reserved. This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2020112924934
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2020112924934
Tiivistelmä
Zoonoottiset kampylobakteerit ovat yleinen ihmisen ruoansulatuskanavan tulehdusten aiheuttaja teollisuusmaissa. Tartunta tapahtuu pääasiassa kontaminoituneiden elintarvikkeiden, kuten huonosti kypsennetyn lihan, välityksellä. Suomessa rekisteröidään vuosittain noin 4000—5000 kampylobakteeritartuntaa.
Opinnäytetyö oli osa Helsingin yliopiston elintarvikehygienian ja ympäristöterveyden osaston laajempaa tutkimusta, jonka tarkoituksena on tutkia eri kampylobakteerilajien esiintyvyyttä kotimaisissa naudanmaksatuotteissa. Työn tarkoituksena oli kerätä aikaisempaa kattavampaa tietoa kampylobakteerien diversiteetistä tutkimusryhmän käyttöönottamalla reaaliaikaisella PCR-menetelmällä. Työssä tarkasteltiin myös inkubaatiolämpötilan ja -ajan mahdollista vaikutusta eri lajien kasvuun.
Näytteenä käytettiin naudan maksan veristä kudosnestettä. Kudosnestettä viljeltiin selektiiviselle kasvualustalle kampylobakteerien eristämiseksi muusta maksan mikrobistosta. Viljelyjä kasvatettiin 24—72 tuntia kahdessa eri lämpötilassa. Jokaisesta maljalle kasvaneesta pesäkkeestä valmistettiin solulysaatti, jota hyödynnettiin templaattina reaaliaikaisessa PCR:ssä.
Näytteistä (N = 20) tutkittiin yhteensä 189 pesäkettä, joista 167 (88 %) todettiin positiiviseksi. Yhteensä 17 näytettä todettiin positiiviseksi kampylobakteerien suhteen. Positiivisista pesäkkeistä 72 % määritettiin Campylobacter jejuniksi ja 28 % Campylobacter fetukseksi. Inkubaatiolämpötilan ja -ajan vaikutuksen tarkastelussa C. fetus -pesäkkeiden havaittiin ilmenevän todennäköisimmin 37 °C:ssa 72 tunnin inkubaation jälkeen. C. jejuni -pesäkkeet kasvoivat yleisimmin 41,5 °C:ssa kahden vuorokauden inkubaatiolla.
Saadut tulokset antoivat tutkimusryhmälle tärkeää lisätietoa naudan maksassa esiintyvien kampylobakteerien diversiteetistä sekä olosuhteiden vaikutuksesta bakteerien kasvuun. Tuloksia tullaan hyödyntämään tulevaisuudessa julkaistavassa artikkelissa.
Opinnäytetyö oli osa Helsingin yliopiston elintarvikehygienian ja ympäristöterveyden osaston laajempaa tutkimusta, jonka tarkoituksena on tutkia eri kampylobakteerilajien esiintyvyyttä kotimaisissa naudanmaksatuotteissa. Työn tarkoituksena oli kerätä aikaisempaa kattavampaa tietoa kampylobakteerien diversiteetistä tutkimusryhmän käyttöönottamalla reaaliaikaisella PCR-menetelmällä. Työssä tarkasteltiin myös inkubaatiolämpötilan ja -ajan mahdollista vaikutusta eri lajien kasvuun.
Näytteenä käytettiin naudan maksan veristä kudosnestettä. Kudosnestettä viljeltiin selektiiviselle kasvualustalle kampylobakteerien eristämiseksi muusta maksan mikrobistosta. Viljelyjä kasvatettiin 24—72 tuntia kahdessa eri lämpötilassa. Jokaisesta maljalle kasvaneesta pesäkkeestä valmistettiin solulysaatti, jota hyödynnettiin templaattina reaaliaikaisessa PCR:ssä.
Näytteistä (N = 20) tutkittiin yhteensä 189 pesäkettä, joista 167 (88 %) todettiin positiiviseksi. Yhteensä 17 näytettä todettiin positiiviseksi kampylobakteerien suhteen. Positiivisista pesäkkeistä 72 % määritettiin Campylobacter jejuniksi ja 28 % Campylobacter fetukseksi. Inkubaatiolämpötilan ja -ajan vaikutuksen tarkastelussa C. fetus -pesäkkeiden havaittiin ilmenevän todennäköisimmin 37 °C:ssa 72 tunnin inkubaation jälkeen. C. jejuni -pesäkkeet kasvoivat yleisimmin 41,5 °C:ssa kahden vuorokauden inkubaatiolla.
Saadut tulokset antoivat tutkimusryhmälle tärkeää lisätietoa naudan maksassa esiintyvien kampylobakteerien diversiteetistä sekä olosuhteiden vaikutuksesta bakteerien kasvuun. Tuloksia tullaan hyödyntämään tulevaisuudessa julkaistavassa artikkelissa.