QIAgility-pipetointirobottien verifiointi

Abstract

Opinnäytetyö tehtiin syksyllä 2011 Keskusrikospoliisin rikosteknisen laboratorion biologian linjalla Vantaalla. Työn tavoitteena oli verifioida kaksi Qiagenin QIAgility-pipetointirobottia kvantitatiivisen PCR:n reaktioreagenssien annosteluvaiheen ja PCR:n laimennosvaiheen automatisoimiseksi.

Työssä tarkastellut spesifikaatiot olivat toistettavuus, luotettavuus, herkkyys ja tulosten oikeellisuus. Ongelmat pipetointirobotin toiminnassa aiheuttivat sen, että useiden toimintatestien näytteiden qPCR-monistuksessa havaittiin satunnaista epäspesifistä monistumista. Ongelmaa yritettiin ratkaista erilaisilla toimenpiteillä, kuten QIAgility-pipetointirobotin uudelleenkalibroinnilla. Toimenpiteillä ei kuitenkaan ollut vaikutusta pipetointirobotin toimintaan. Myöhemmin QIAgilityista löydettiin muutamia valmistusvirheitä, jotka saatiin korjattua. Työssä ilmenneiden ongelmien vuoksi laitteiden valmistajille tullaan pitämään kertauskoulutusta laitteiden valmistuksessa ilmenneiden huolimattomuuksien vuoksi.

Ajan puutteen vuoksi opinnäytetyön tavoitteisiin ei vielä päästy. Qiagenin QIAgility-pipetointirobottien sekä työn ohessa käytettyjen Qiagenin Rotor-Gene Q-qPCR -laitteiden verifiointia ja Qiagenin InvestigatorTM Quantiplex -kitin testausta jatketaan edelleen Keskusrikospoliisin rikosteknisessä laboratoriossa.

The thesis was made at the National Bureau of Investigation´s laboratory in the line of biology in Vantaa in autumn 2011. The goal of the work was to verify Qiagen´s two QIAgility-pipetting robots to automate quantitative-PCR´s dose of reaction reagents and PCR-reactions dilution.

The specifications which were examined were repeatability, reliability, sensitivity and accuracy of measurement. The problems with functioning of pipetting robots caused random non-specific amplification of the DNA in many tests. The samples of tests were amplified with qPCR. Resolving the problems was attempted with several actions, for example recalibrating the QIAgility-pipetting robots, but those actions didn´t affect the function of devices. Later, there were found couple of manufacturing errors, which were repaired. Because of the carelessness in manufacturing of the pipetting robots caused problems, which were found during the tests of devices function, the manufacturer will be reeducated.

The goals of the thesis weren’t reached because of lack of time. Verifying of the Qiagens QIAgility–pipetting robots and the Rotor-Gene Q-qPCR –device and testing of Qiagens InvestigatorTM Quantiplex Kit needs to be continued in the National Bureau of Investigation´s laboratory.