IL28B-geenipolymorfismi HCV-potilailla

Abstract

Yhtä emästä koskevan IL28B-geenin polymorfismin on todettu vaikuttavan hepatiitti C -potilaan hoitovasteeseen. C-genotyyppi voidaan yhdistää parempaan hoitovasteeseen kuin CT- tai TT-genotyypit. Potilaan genotyypin tutkiminen tukee hoidon suunnittelua. Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli tutkia suomalaisten potilaiden genotyyppejä IL28B rs12979860 -geenipolymorfismin suhteen. Tutkimus suoritettiin käyttämällä LightCycler-kemiaan pohjautuvaa reaaliaika-PCRmenetelmää. Monistustuote osoitettiin kaupallisen pakkauksen spesifisillä koettimilla sulamiskäyräanalyysissä. Potilasnäytteitä tutkittiin 80. Potilaista suurin osa, 51,25 %, oli genotyyppiä CC. Genotyyppiä CT oli 41,25 %, ja genotyyppiä TT oli 7,5 %. Tulokset vastaavat osaltaan aiemmin tehtyjä analyyseja. Tulokset osoittavat, että suomalaisista potilaista suurella osalla on IL28B-geenin alleelli, jonka kantajilla on todettu hyvä hoitovaste hepatiitti C:n lääkityksessä. Käytetyt menetelmät osoittautuivat toimiviksi genotyyppaustutkimusta varten.

A single nucleotide polymorphism of the IL28B gene has been proven to associate with response to the treatment of patients with hepatitis C. The response is better in patients with genotype CC compared with CT or TT. Analyzing the patient’s genotype supports treatment planning. The objective of this study was to analyze the genotypes of Finnish patients regarding IL28B rs12979860 genetic polymorphism. The study was carried out using the LightCycler chemistry-based real-time PCR method. The sequence of the multiplied product was indicated using melting curve analysis and the specific probes of a commercial kit. 80 patient samples were analyzed. Most of the patients, 51,25%, had the CC allele. 41,25% had the CT allele and 7,5% had the TT allele. The results correlate to previous studies. The results showed that a majority of the Finnish patients had such a genotype of IL28B gene, which is associated with response to medicinal therapy of hepatitis C. The methods used in this study proved functional for the genotyping analysis.