PaTu : Patologian tutkimustietokannan suunnittelu

Abstract

Tässä insinöörityössä tuotettiin ratkaisu Itä-Suomen yliopiston patologian yksikön rintasyöväntutki-musprojektin tiedontallennus ongelmaa. Projektissa useat tutkijat pitivät omia tutkimustiedostojaan omalla tietokoneellaan tallennettuina. Tämän lisäksi tiedostoja oli tallennettu yhteiselle verkkolevylle. Tämä aiheutti ongelman silloin, kun haluttiin hakea viimeisintä versiota halutusta tutkimusaineistos-ta.

Tämän ongelman ratkaisemiseksi suunniteltiin tietokanta ja kuvattiin tiedonsiirto lähdemateriaalista tietokantaan. Työ suunniteltiin MySQL Workbench -suunnitteluohjelmalla ja tiedonsiirtoa kuvannet-tiin Excel-taulukkoon. Työ tehtiin Itä-Suomen yliopiston tiloissa. Suunnitteluun käytettiin noin kolme kuukautta ja tästä ajasta käytettiin noin kuukausi tutkimusprojektiin perehtymiseen, sekä tarpeen kartoittamiseen.

Työn tuloksena tuotettiin tämän raportin lisäksi MySQL Workbench:llä toteutettu suunnitelma tieto-kannasta ja tutkimusaineiston siirtoa tietokantaan kuvaavia dokumentteja, jotka eivät ole sisällytet-tynä kokonaisuudessaan tähän dokumenttiin. Nämä tiedostot on luovutettu asiakkaalle.

This thesis addressed the issue of data saving problem on a breast cancer treatment project in the department of pathology at University of Eastern Finland. Several researchers kept their own mate-rials on their own computers along with some files being saved to shared network folders. This re-sulted in data fragmentation.

To solve this data fragmentation problem a database was designed and dataflow between data source and database was mapped. MySQL Workbench was used to design the database and data-flow was outlined in Excel worksheets. This thesis was done in the facilities provided by University of Eastern Finland. The designing of this work took about three months from which about one month was used to getting familiar with the client’s project.

The result of this thesis included the database planned with MySQL Workbench, documents de-scribing dataflow from source material to the database and this document. All these documents were delivered to the client.