Oikeusgeneettisen yksilöntunnistuskitin verifiointi
Vares-Kurvinen, Malriin (2024)
2024
All rights reserved. This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2024050810082
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2024050810082
Tiivistelmä
Tämä opinnäytetyö tehtiin Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen oikeusgenetiikan laboratoriossa ja sen tarkoituksena oli verifioida uusi yksilöntunnistuskitti tiimin käyttöön. THL:n oikeusgenetiikan tiimi kuuluu oikeuskemian yksikköön, ja sen tehtäviin kuuluu lakisääteiset oikeusgeneettiset isyystutkimukset ja perhesidetutkimukset.
Yksilöntunnistustutkimuksissa (isyys- ja sukulaisuustutkimukset, vainajan tunnistus) monistetaan DNA-merkkejä, joissa väestössä esiintyy hyvin paljon erilaisia muotoja, tässä tapauksessa eripituisia DNA-jaksoja. Muotojen pituuserot johtuvat kullekin merkille ominaisen ns. toistojakson erilaisesta toistumismäärästä. Vertailemalla DNA-merkkien tuloksia tutkituilla voidaan tutkimuksessa testattava sukulaisuusoletus (esim. isyys) vahvistaa tai poissulkea.
Verifiointiprosessissa testattiin erilaisia näytetyyppejä ja eristysmenetelmiä sekä selvitettiin uuden kitin yhteensopivuutta muiden käytössä olevien STR-kittien kanssa. PCR-olosuhteet optimoitiin ja tulokset analysoitiin GeneMapper™ ID-X -ohjelmalla, jonka jälkeen saatuja tunnisteita verrattiin aiemmin saatuihin tunnisteisiin. Prosessi sujui pääosin suunnitellusti.
Analyysivaiheessa todettiin, että VeriFiler™ Plus -kitti tuotti luotettavia ja toistettavia tuloksia, jotka vastasivat odotuksia ja aiempia tuloksia. Tämä osoitti, että kitti soveltuu laboratorion tarpeisiin ja se täyttää sille asetetut kriteerit.
Yksilöntunnistustutkimuksissa (isyys- ja sukulaisuustutkimukset, vainajan tunnistus) monistetaan DNA-merkkejä, joissa väestössä esiintyy hyvin paljon erilaisia muotoja, tässä tapauksessa eripituisia DNA-jaksoja. Muotojen pituuserot johtuvat kullekin merkille ominaisen ns. toistojakson erilaisesta toistumismäärästä. Vertailemalla DNA-merkkien tuloksia tutkituilla voidaan tutkimuksessa testattava sukulaisuusoletus (esim. isyys) vahvistaa tai poissulkea.
Verifiointiprosessissa testattiin erilaisia näytetyyppejä ja eristysmenetelmiä sekä selvitettiin uuden kitin yhteensopivuutta muiden käytössä olevien STR-kittien kanssa. PCR-olosuhteet optimoitiin ja tulokset analysoitiin GeneMapper™ ID-X -ohjelmalla, jonka jälkeen saatuja tunnisteita verrattiin aiemmin saatuihin tunnisteisiin. Prosessi sujui pääosin suunnitellusti.
Analyysivaiheessa todettiin, että VeriFiler™ Plus -kitti tuotti luotettavia ja toistettavia tuloksia, jotka vastasivat odotuksia ja aiempia tuloksia. Tämä osoitti, että kitti soveltuu laboratorion tarpeisiin ja se täyttää sille asetetut kriteerit.