Rotavirusten seuranta Suomessa

Abstract

Opinnäytetyö toteutettiin Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksessa (THL), Virusinfektiot-yksikössä. Työn tavoitteena oli selvittää rotavirusten aiheuttamaa sairastuvuutta eri ikäryhmissä ja tunnistaa Suomessa kiertävät rotavirusgenotyypit ja niiden jakaumat. Lisäksi, selvittää, että suojaako rokote kaikilta rokotuksessa olevilta genotyypeiltä ja esiintyykö uusia genotyyppejä/reassortantteja.

Virusinfektiot-yksikkö vastaa koko Suomen rotavirusseurannasta. Suomessa käytettävä rokote (RotaTeq®) on ollut kansallisessa rokotusohjelmassa vuodesta 2009 alkaen. Ennen rokotetta rotavirusten aiheuttamat ripuliepidemiat sairastuttivat Suomessa vuosittain n. 20 000 alle 5-vuotiasta lasta (ilmaantuvuus 460/100 000), joista yli puolet tarvitsi terveydenhuollon palveluja. Rotavirusinfektiot ovat vähentyneet rokotteiden ansiosta (2013, 44/100 000), mutta viruksia esiintyy silti. Yleisimmin tautia aiheuttavat rotavirustyypit tulevat harvinaistumaan ja mahdollisesti korvautumaan toisilla taudinaiheuttamiskyvyltään muuntuneilla virustyypeillä. Seuranta on tärkeää, ja sitä on jatkettava uusien syntyvien kantojen havaitsemiseksi ja estämiseksi. Rotavirus on kuulunut 1.5.2013 alkaen tartuntatautilain ja -asetuksen mukaiseen mikrobikantakokoelmaan. Näin ollen rotaviruspositiiviset näytteet lähetetään THL:n Virusinfektiot-yksikköön tyypitettäväksi. Tarkoituksena on seurata, mitkä genotyypit kiertävät Suomessa rokotuksista huolimatta.

Rotavirus on pieni, kaksisäikeinen RNA-virus, ja se on yleisin lasten akuutin suolistotulehduksen aiheuttaja kehittyneissä maissa. Tartuntatautirekisteriin (TTR) ilmoitettiin vuoden 2013 aikana 282 rotavirusinfektiota, joista saatiin yksikköön tutkittavaksi 73 positiivista näytettä. Näytteet tutkittiin käyttäen käänteiskopiointia ja reaaliaikaista polymeraasiketjureaktiota (RT-qPCR), minkä jälkeen ne tyypitettiin geneettisesti. Tutkimuksen näytteistä 53 % oli miespuolisilta ja 47 % naispuolisilta henkilöiltä, ja näytteistä puolet oli alle 5-vuotiailta lapsilta. Yleisin näytteistä löydetty genotyyppi oli G1P[8], joka on myös muissa teollisuusmaissa yleisin. Muita useimmin tavattuja genotyyppejä olivat G2P[4], G3P[8], G4P[8] ja G9P[8].

The final thesis was carried out in the Viral Infections Unit in the National Institute for Health and Welfare (THL). The aim was to study the rotavirus-induced morbidity in different age groups and to identify rotavirus genotypes circulating in Finland and their distributions. Also, to find out does the vaccine protect children against all genotypes and the occurrence of new genotypes / reassortant.

The Viral Infections Unit is responsible for the rotavirus surveillance program in Finland. Since 2009, the Finnish authorities have included the rotavirus vaccine (RotaTeq®) in the national immunization program. Before the vaccination, rotavirus affected 20 000 children under 5 years of age per year (incidence of 460/100 000), of which more than half needed primary health care services. Rotavirus infections have been reduced by more than 10 fold (2013, 44/100 000); however, the viruses still exist. The vaccination will probably reduce the most common rotavirus genotypes, which will possibly be replaced by other uncommon genotypes. Follow-up is important, and it should continue for the detection and prevention of new genotypes. For this reason, rotaviruses have been included in the Communicable Diseases Act and Decree as part of the microbe strain collection since May 2013. Thus, diagnostic laboratories must send rotavirus positive specimens to the THL's Viral Infections Unit for typing.

Rotaviruses are small, double-stranded RNA viruses. They are the most common causative agents of children’s acute gastroenteritis in developed countries. According to the infection disease register (TTR), 282 cases were registered during 2013. Only 73 positive samples were received in the Viral Infections Unit. The samples were studied using reverse transcription and real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR), followed by genetic typing. As much as 53 % of the samples were from males and 47 % from females. Half of the samples were collected from children under 5 years of age. G1P[8] was the most common genotype found. This genotype is the most common also in other industrialized countries. The other mostly detected genotypes were G2P[4], G3P[8], G4P[8] and G9P[8].