Sulamiskäyräanalyysi RT-PCR-laitteella : menetelmän testaus ja työohjeen laatiminen bioanalyytikko-opiskelijoille
Ritvanen, Jenna; Nuutinen, Sanna; Tietäväinen, Katja (2025)
2025
All rights reserved. This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2025121034505
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2025121034505
Tiivistelmä
Molekyylibiologia on yksi ammatillisista opinnoista bioanalyytikon tutkinto-ohjelmassa. Molekyylibiologian laboratorioissa bioanalyytikko tutkii muun muassa geneettistä materiaalia, kuten DNA:ta, ja suorittaa erilaisia mittauksia hyödyntäen PCR-sovelluksia. RT-PCR eli reaaliaikainen polymeraasiketjureaktio on yksi käytetyimmistä molekyylibiologisista menetelmistä eri erikoisalojen laboratorioissa. Kehittämistyön tarkoituksena oli testata Bio-Radin CSI-laajennuskitin sulamiskäyräanalyysia RT-PCR-menetelmällä koulun Roche LightCycler® 96 -laitteella ja tuottaa siitä työohje bioanalyytikko-opiskelijoille. Kehittämistyön tavoitteena oli pidentää nykyisen laitekannan käyttöikää ja samalla nykyaikaistaa koulun laboratorioharjoituksien sisältöä.
Opinnäytetyö toteutettiin tutkimuksellisena kehittämistyönä lineaarisen mallin mukaisesti. Työn tilaajana toimi Savonia-ammattikorkeakoulu. Tutkimuksellinen kehittämistyö toteutettiin testaamalla sulamiskäyräanalyysia RT-PCR-menetelmällä koululla olevalla laitteella. Suoritettujen ajojen avulla arvioitiin menetelmän soveltuvuutta opetuskäyttöön. Menetelmää testattiin ja saatujen tulosten perusteella luotiin toimiva ajoprotokolla olemassa olevalle laitteelle sekä työohje bioanalyytikko-opiskelijoille menetelmän suorittamiseen.
Opinnäytetyö koostui suoritetuista testiajoista, laitteen optimoinnista ja kirjallisesta raportista sekä tuotoksesta eli työohjeesta opiskelijoille molekyylibiologian syventävälle kurssille. Palautetta kysyttiin oman vuosikurssin opiskelijoilta työohjeen jäsentelystä, ymmärrettävyydestä, kielen selkeydestä ja opiskelijoiden kyvystä työskennellä itsenäisesti ohjeen mukaan sekä mahdollisista kehittämisehdotuksista. Lisäksi työohjeesta pyydettiin myös palautetta työn tilaajalta eli molekyylibiologian opettajalta. Palautteen perusteella ohjeeseen tehtiin vielä hyvin pieniä muutoksia. Jatkokehittämisideana voisi tuottaa videon taitopajoissa suoritettavaan harjoitustyöhön.
Opinnäytetyö toteutettiin tutkimuksellisena kehittämistyönä lineaarisen mallin mukaisesti. Työn tilaajana toimi Savonia-ammattikorkeakoulu. Tutkimuksellinen kehittämistyö toteutettiin testaamalla sulamiskäyräanalyysia RT-PCR-menetelmällä koululla olevalla laitteella. Suoritettujen ajojen avulla arvioitiin menetelmän soveltuvuutta opetuskäyttöön. Menetelmää testattiin ja saatujen tulosten perusteella luotiin toimiva ajoprotokolla olemassa olevalle laitteelle sekä työohje bioanalyytikko-opiskelijoille menetelmän suorittamiseen.
Opinnäytetyö koostui suoritetuista testiajoista, laitteen optimoinnista ja kirjallisesta raportista sekä tuotoksesta eli työohjeesta opiskelijoille molekyylibiologian syventävälle kurssille. Palautetta kysyttiin oman vuosikurssin opiskelijoilta työohjeen jäsentelystä, ymmärrettävyydestä, kielen selkeydestä ja opiskelijoiden kyvystä työskennellä itsenäisesti ohjeen mukaan sekä mahdollisista kehittämisehdotuksista. Lisäksi työohjeesta pyydettiin myös palautetta työn tilaajalta eli molekyylibiologian opettajalta. Palautteen perusteella ohjeeseen tehtiin vielä hyvin pieniä muutoksia. Jatkokehittämisideana voisi tuottaa videon taitopajoissa suoritettavaan harjoitustyöhön.