Chlamydia pneumoniaen havainnointimenetelmien kehittäminen
Räisänen, Katja (2010)
2010
All rights reserved. This publication is copyrighted. You may download, display and print it for Your own personal use. Commercial use is prohibited.
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2023083125180
https://urn.fi/URN:NBN:fi:amk-2023083125180
Tiivistelmä
Chlamydia pneumoniae on solunsisäinen mikrobi, joka aiheuttaa yleisesti hengitystietulehduksia. Krooninen C. pneumoniae -infektio on yhdistetty useisiin kansanterveydellisestikin merkittäviin sairauksiin. Kroonisissa infektioissa C. pneumoniae on kuitenkin vaikea havainnoida. Havainnointiin käytetään usein PCR-tekniikkaa. Opinnäytetyön tavoitteena oli kehittää menetelmä, joka parantaisi C. pneumoniaen havainnoinnin herkkyyttä.
Työssä tutkittiin kahta erilaista lähestymistapaa havainnoinnin parantamiseksi magneettipartikkeleiden avulla. Ensimmäisellä menetelmällä C. pneumoniae yritettiin erottaa kokonaisina bakteereina isäntäeliön kudoksesta. Toisella menetelmällä C. pneumoniaen DNA koetettiin puhdistaa poistamalla isäntäeliön DNA. Tulokset kokeista saatiin reaaliaikaisen, kvantitatiivisen PCR:n avulla.
Tutkituilla menetelmillä ei onnistuttu parantamaan C. pneumoniaen havainnoinnin herkkyyttä. C. pneumoniaen erottaminen kokonaisina bakteereina osoittautui kannattamattomaksi isäntäkudoksen homogenisoinnin ongelmien takia. C. pneumoniaen DNA:n puhdistaminen epäonnistui kokeissa tehtyjen virheiden vuoksi.
Työssä tutkittiin kahta erilaista lähestymistapaa havainnoinnin parantamiseksi magneettipartikkeleiden avulla. Ensimmäisellä menetelmällä C. pneumoniae yritettiin erottaa kokonaisina bakteereina isäntäeliön kudoksesta. Toisella menetelmällä C. pneumoniaen DNA koetettiin puhdistaa poistamalla isäntäeliön DNA. Tulokset kokeista saatiin reaaliaikaisen, kvantitatiivisen PCR:n avulla.
Tutkituilla menetelmillä ei onnistuttu parantamaan C. pneumoniaen havainnoinnin herkkyyttä. C. pneumoniaen erottaminen kokonaisina bakteereina osoittautui kannattamattomaksi isäntäkudoksen homogenisoinnin ongelmien takia. C. pneumoniaen DNA:n puhdistaminen epäonnistui kokeissa tehtyjen virheiden vuoksi.